保证注册会计师的独立性可以从机构独立、人员独立、经济独立等方法保持独立性,必须做到实质上和形式上的独立。1、机构独立为确保审计机构独立地行使审计监督权,审计机构必须是独立的专职机构,应单独设置,与被审计单位没有组织上的隶属关系。2、人员独立审计人员不能是被审计单位最近几年的员工,与被审计单位高层不得有直系亲属关系。审计人员必须具有相应的技术能力,能独立执业,不受外部力量影响其判断。审计小组应配备具有相应能力的不影响独立性的员工,其余员工应予回避。3、经济独立为确保审计人员能够实事求是地检查、客观公正地评价与报告,审计人员与被审计单位应当不存在任何经济利益关系,不参与被审计单位的经营管理活动;如果审计人员与被审计单位或者审计事项有利害关系,应当回避。