绿斑藻通常附着于光线较强的 水族缸玻璃面或者成长缓慢的水草上面。绿藻成员，约6,000种典型的绿藻细胞可活动或不能活动。具有一中央液泡，色素在质体中，质体形状因种类而异。
绿斑藻质地很坚硬，常见的食藻鱼对于清除绿斑藻的功效实在有限。当绿斑藻出现时，可考虑使用 K2HPO4 或 KH2PO4 来增加水中的磷酸浓度，瑞典的 Dusko Bojic 认为将磷酸控制在 0.3~0.5 ppm 能有效的抑制绿斑藻，但根据我自己使用德国 sera 磷酸测试工具的纪录来看，当水族缸的磷酸超过 1 ppm 以上，绿斑藻就不再出现了。
绿藻的细胞壁由两层纤维素和果胶质组成，食物以淀粉的形式储存于质体内的蛋白核中。叶绿体被两层细胞膜包围着，所以有猜测说它们可能是直接由蓝菌的内共生而得来的。部份蓝菌有类似的色素沉着，但这似乎出现不只一次，而绿藻的叶绿体也不再被认为和此类型的关系相近。
