在水草缸中，水草、鱼虾、微生物三者是相互共存的，当生态达到良好的平衡状态时，水质则呈现闪烁的透明水，反之浑浊如雾。
何谓浑浊
将精制盐溶入水中，所得到的溶液是清澈的，并不会呈现浑浊现象，若将精制糖溶入水中，亦可得到相同的结果。像这一类的物质，完全溶入水中时，所得到的溶液是相当的清澈，因为这些物质以十分小的单位（原子或分子），在水中均匀的扩散，就如一般的自来水中也都溶有硝酸、氯气等物质在其中，而所见到的却是清澈如镜的水一样。
如果在水中加入面粉，以勺子搅拌后，水是呈现白色浑浊，经过一段时间面粉大部分会往下沉淀，澄清的部分与沉淀是分开的，因为面粉无法溶于水，而产生浑浊现象。
所谓浑浊，是有一定程度大的粒子（1μm以上）在水中漂浮的状态，我们所使用的自来水是没有浑浊现象，但在自然界中的湖泊或河川多少都会有浑浊情形，因水中含有许多悬浮物质而产生浑浊，悬浮物质中包含有机物、无机物、生物、非生物，浑浊的产生也没有固定的原因。
水草缸的浑浊现象也没有特定的因素，只是相较于野外而言，影响的变数较少，而比较容易找到原因罢了。
清晰与浑浊
在水草缸中，水草、鱼虾、微生物三者是相互共存的，当生态达到良好的平衡状态时，水质则呈现闪烁的透明水。
在旧水缸水质产生变化，或新设缸生态尚未健全时，易发生水质浑浊；虽然在更换新水后的一段时间水质会澄清，经数小时后仍呈浑浊状态，其原因是未经消毒处理的新水注入或新鱼只、新水草移入时，所附着的浮游生物、藻类、藻类孢仔、原生动物等进入水缸；或鱼饲料的投入超量，沉淀腐败有机物及细菌在突然间增多时，原来水缸中正常量的微生物群一时无法分解过多的有机物，而使得水质恶化，导致水质浑浊，严重时尚带有异味散发于空气中。
白浊的水质
白浊的水质通常出现在初设缸时，一般多是因为原生动物的繁殖，造成水质白浊，但也有少部分是因为使用砂石中所含石灰质造成的白浊现象。
一般性状况为初设缸后次日起，因水中生态未建立，显现白色水质，倘未予即时处理时，至第四天水质便成走动状（水流）的白云雾状。
