吴三桂还不算绝情，他在政治上对永历帝朱由榔冷血，严密拘禁，在生活上却给予了他们良好的待遇。永乐帝依然是以前的皇家装束，头戴“马鬃瓦棱帽”，身穿“纯绢大袖袍”，腰系“黄丝带”，“举止有度”，衣着讲究。
加上永历帝身材魁伟，体态丰满，相貌堂堂，年方39岁，显出一副英武之气，仍不失皇帝风度。他被囚禁在室内，经常端坐不动，不管谁来送饭，或有人来观看，他都无动于衷，一语不发。有一名士兵看后，不禁赞叹：“这才是真皇帝呀！”
吴三桂也抽空见了他一面，但受到了永历帝朱由榔大义凛然的谴责，使英雄一世的吴三桂也不由得胆战心惊，再也不敢见了。永历帝的户部尚书龚彝置办了酒肴，准备进献给永历帝，守卫的士兵不许。龚彝厉声说：“我为臣子，面见我君。有何不可？况君臣大义，纵夷狄也不能忽略。我求见君面，何阻挠之甚？”守卫的士兵不敢自专，请示吴三桂，因为心中有愧，就准许进去探视。
龚彝把酒宴摆好，请永历帝出来，向他行三跪九拜之礼后，恭恭敬敬地把酒端起奉上。永历帝本不善饮酒，此时此境，有风萧萧之意绪，大为伤怀，顿时痛哭不已。龚彝伏在地上也涕泗交流，劝之再三，永历帝勉强饮了三爵，龚彝再拜不止。
突然一跃而起，用力以头触柱，脑浆迸裂而死。永历猝不及防，一下子惊呆了，待反应过来后，即扑到他的尸体上，悲痛欲绝，哭昏了过去……
永历帝和他的母亲、妻子既已成了吴三桂的阶下囚，是生，是死，他们无法知道，他们等待着最后的结果。在度日如年的日子里，只有悲哀和眼泪伴随着他们。然而，最后的命运很快就降临到他们的面前！
据与明史专家彭勇教授交谈得知，清军中有一甲喇章京军官，暗中联络一些满人，准备劫持永历帝，逃往陕西，奉为君主，“以成不世之功”。但由于处事不慎，走漏了消息。吴三桂非常恐慌，迅速逮捕了密谋起事的11名首犯，以最残酷的磔刑处死。为防止夜长梦多，再生变故，吴三桂加速了对永历的处置决定。
吴三桂上书清廷，直言如将永历帝押送北京，可能中途有被反清人士劫夺的危险。经清廷批准，就地正法。吴三桂遂于4月14日，将朱由榔及其眷属25人押到昆明篦子坡执行绞刑。王皇后就在被清军押解的途中，想着一代皇后，就这样屈辱而死，心实不甘，与其受辱而死，不如悲壮而死。
于是她与马太后互相勉励，在槛车中自相扼喉而死。壮哉！烈女皇后。就在她们断气的那一刻，天降大雨，山川也为之同悲！
其实，永历政权同弘光、隆武政权一样，腐败不堪，但永历帝个人的一些品行，颇为人所称道。他作风朴实，厌恶繁华，不饮酒，也无声色之好，喜闻和谈论忠义事，奉母至孝，待妻恩爱，他的这些美好的品质博得了人们的赞赏。又因为他和王皇后是一对贤伉俪，死得如此悲惨，颇能激起人们更多的同情，洒下更多哀伤的泪水。一些对新政权不满的人，也就从中寄托着怀念故国之情。
