进入遗址保护展示厅，最先看到的是一个壮观的车马坑遗址，它是晋侯稣及夫人墓葬的陪葬坑，东西长21米，南北宽14米，面积约等于一个标准篮球场，是西周时期最大的车马坑，比秦始皇兵马俑早了600年。真实的情况真是如此吗？
晋国博物馆依托“曲村——天马遗址”建成，是一座集文物收藏、保护、研究和文物遗迹展示为一体的山西省首座大型遗址博物馆，也是全国唯一一座完整展示晋文化的平台，博物馆由主要三大展厅组成：出土文物陈列厅、遗址发掘史展厅、遗址保护展示厅。
在出土文物陈列厅中，展品陈列以唐、晋古国之前的仰韶、龙山文化时期为肇始，到晋国消失后的韩、赵、魏三国雄起结尾，从“曲村——天马遗址”出土的众多青铜、玉、石、金、陶等10多类文物中，精选了数百件精品。
从第一个展厅开始，给人印象深刻的不仅是展品之丰富，历史之悠久，还有晋国博物馆充满了现代化气息的陈展设计。据晋国博物馆工程建设副总指挥、原曲沃县文物旅游管理中心主任孙永和介绍，晋国博物馆的陈展设计方案经过四次大规模改动，其中小规模调整不计其数，设计者花费了大量心血，最终才设计出如今这种现代与古典相交融的陈展方案。
博物馆的展览柜选用了新型无反光玻璃，大大提高了文物的展示效果，为观众带来更美妙的视觉体验，同时也满足了文物陈列的安全要求。此外，不同于传统博物馆，晋国博物馆在展厅的隔断上做了创新，汲取现代艺术展览元素。
将隔断设置为黑色纱网，将人流有效隔开，又避免了视线上的遮挡。展厅地面选用镜面黑色珍珠岩，顶棚由一块块的玻璃拼接而成，地板和天花板反射灯光，通透无比，营造出一种神秘肃穆又现代简约的展厅氛围。
晋国博物馆的另一个独特之处，就是不仅仅展示文物和遗址，还专门设置了一个遗址发掘史展厅，展示了北京大学考古文博学院和山西省考古研究所三代考古学人历经艰辛数十年，博览地书、寻觅求证的经过和考古发掘工作取得的一系列重大成果。
进入遗址发掘史展厅，仿佛进入了一个时空隧道，右手边的展柜里陈列着三代考古学人使用的工具和生活用品，左手边的展板上详尽地介绍了“曲村——天马遗址”的发掘历史：从1962年“曲村——天马遗址”被发现开始，分别讲述了1963年由山西省文物工作委员会和北京大学历史系考古专业第一次试掘，1979年第二次试掘。
开始了以探究晋文化主题为目的的大规模考古发掘活动，至上世纪80年代末，在曲村北发现了贵族的邦墓区，在遗址的中部还有大批的居住址、灰坑、窖穴，出土大量珍贵的文物。到1992年春天开始，考古工作者连续发掘，共发掘9组19座晋国早期的晋侯和夫人墓葬、18座陪葬墓、2座车马坑，出土一批轰动海内外的珍贵文物。
更值得一提的是，在遗址发掘史展厅还设置了我国着名考古学家邹衡先生的蜡像，蜡像之逼真，让几乎所有看到蜡像的人都以为是真人。邹衡先生的蜡像衣着朴素，坐在写字台前挑灯工作，为观众还原了我国老一辈考古学家的工作场景。
晋国博物馆拥有规模宏大的晋侯墓地遗址陈列，墓地东西长约150米，南北宽约130米，共有大型墓葬9组19座，所属时代从西周早中期之交到春秋初年。值得一提的是，遗址保护展示厅分为室内、室外两个部分，室内展示4组9座晋侯及夫人墓葬和3座车马坑，作为复原性展示。室外展示5组晋侯及夫人墓葬和6座车马坑，作为标志性展示。
进入遗址保护展示厅，最先看到的是一个壮观的车马坑遗址，它是晋侯稣及夫人墓葬的陪葬坑，东西长21米，南北宽14米，面积约等于一个标准篮球场，是西周时期最大的车马坑，比秦始皇兵马俑早了600年。
更为特别的是，车马坑内共有车48辆，马至少105匹，均为真车真马，而且陪祀马被埋时都活着，因此可以看到马群挣扎的痕迹。在展厅内还有两座未被挖掘的车马坑，博物馆在原址之上放置了车马的复制品，可以让观众能够更直观地了解当时的历史情况。
展厅内所展出的墓葬不仅数量众多，而且在展示方法上也十分讲究，营造出一墓一景，步步惊喜的参观效果。展厅采用纵向立面和横向平面展示的方法，选择不同层面在发掘时的不同场景内容，观众能够尽可能多的了解当时丧葬习俗的各种内容，避免了重复和雷同。
