燕王朱棣后来起兵造事，把老子认命的孙子皇帝撵出南京的皇宫，至今下落不明，与朱允炆选择的下葬时间失当有直接关系，成为朱棣要搞他的第一理由。现在，关于朱元璋的死亡时间，有各种说法，一是洪武三十一年闰五月初九，一说是闰五月初五，一说是闰五月十七日等。为什么会有这么多种说法，表面的原因是史书上记载多模糊，如《明史惠帝纪》：“恭闽惠皇帝讳允蚊，大祖孙，懿文太子第;子也。
葬高皇帝于孝陵，诏行三年丧。”“辛卯”，现在可以确定了，就是洪武三十一年闰五月十六日。从这里推算，朱元璋下葬是他死后的第七天，那么死时间就是当年的闰五月初九。对于朱元璋到底是哪天死的？按说这是很清楚的事情，为什么史书上要写得模糊？这与朱允炆给朱元璋选择下葬时间不当，“嫌其太速，事理有不尽然者”，为掩人耳目啊，故意混淆是非。
现在史学界大多认为，朱允炆确实是”速葬“了朱元璋。那朱允炆为什么敢冒天下之大不韪？有史书上称，这是朱元璋自己选择的时间，”故即位而葬，同日并举，皆高皇遗命，正以速葬消诸。“而秘史更称，朱允炆实际上在即位的前一天，即闰五月十五日把朱元璋给下葬了。这是”领命于地下“。这里说明朱元璋担心自己死后出乱子，留下遗言要朱允炆从速办自己丧事的。而从天气的角度考虑，速葬朱元璋也不无道理。
玩璋到底是哪天死的哪天葬的，下葬前到底发生了什么？根据上面的文字和相关史料可以归结如下，大概是朱允炆在朱元璋一闭眼，就想着即位的事情，而为了不让朱棣诸王回京找事，坏了自己的皇帝大梦，把朱元璋从速埋了，从速上位，并给各王发遗诏，不得回京奔丧。等等。那决定下葬后又发生了什么？这同样是一个谜团。
在南京民间，连小孩子都知道这样的传说，朱元璋下葬那天出现了”迷魂阵“，就是南京的十三个城门同时出殡。此说法史书有记载，朱国桢的《皇明大政记》称，朱元璋下葬那天”而发引，各门下葬“。为什么要这样？在民间，有钱的大户人家，为了干扰视听，防止有人盗墓，有意隐藏先人埋葬地点，而一个皇帝如此这般，实在令人不解。在元朝，帝王无陵寝，搞搞迷魂阵倒是很合乎情理，既然朱元璋生前都为自己的归宿找好了地方。
据说当年孝陵内每到夜里就传出一个妇人的哭声，原来这是马皇后的哭声，后来大搞法事才没有了哭声。马皇后为什么要哭？说是一人空守一座孤坟，悲伤所致啊，”后来孝陵传夜哭，应缘马后悲孤独“，即是这个说法。葬在朝天宫这种说法，倒是给朱允炆”速葬“朱元璋、大摆迷魂阵、十三城门出殡找到了合理的解释和可能性，朝天宫在城里，速葬起来很方便的;如果葬在孝陵内，就没有必要搞假象。
真相恐怕只有等到开挖明孝陵的哪一天才能最终揭开！但这个日子恐怕如开挖始皇陵一样，目前还不可能，很遥远，这也是说，朱元璋到底葬在哪，在相当长的时间内，仍将是一个谜！
