商鞅被车裂，从根本上来说是功高震主的节奏，皇族们根本就是个出头鸟，从秦孝公开始，秦王都不怎么重视皇族。
但从孝公生前行为来看，一方面对商鞅变法与执政的支持，力排众议，表现了对商鞅的信任。但另一方面又始终把商鞅摆在变法与执法的第一线，让商鞅和士族大夫，包括太子，太傅等去做正面的冲突，矛盾全部集中在商鞅身上了。
其实秦孝公知道自己死后，商鞅也活不了多久，因为那么多矛盾都在商鞅身上，他也为商鞅做了不少事，包括缓和商鞅与太子之间的矛盾等。
但为秦国考虑，由继承者除去商鞅却是有益无害的事，一方面可以使那些在变法中受打击的贵族出一口气，缓和统治阶级内部矛盾，提高惠文王的声望。
另一方面，变法的完成已使商鞅失去了原来的价值，且德高望重的老臣是年少的秦惠王难以驾驭的，商鞅悲剧的发生就成了在所难免的事情了，而秦惠文王正好借用了这一手，除掉了商鞅，也震慑了老臣。
至于还有一种说法，孝公在死前曾给予商君一万精锐铁骑，而是商鞅自己为了秦国的安危主动交出了部队，在推荐了司马错和樗里疾两位大才后慷慨赴死，使秦国稳定。
商鞅不死的话，年轻的秦王就会加在商鞅和老臣的中间，使得秦王很难做，而且商鞅功劳太大，秦惠文王有所忌惮，这才是根本问题所在。
