高效皇帝
朱祐樘与父亲朱见深有一个相同点，就是善于耐心听取别人的意见。但俩人的不同点是，朱见深经常只听不做，朱祐樘只要觉得对，就立刻做。
《明史》上对他记录非常多的，就是他的“勤于纳谏”，比如吏部尚书王恕要他把全国各地官员的名字贴在皇宫柱子上，以便随时查阅，朱祐樘当天就贴上了。兵部尚书马文升要朱祐樘节省宫廷开支，朱祐樘立刻下令，从当月的开支开始削减。礼部尚书丘浚给朱祐樘上《大学衍义补》，朱祐樘阅后很高兴，立刻下令福建地区刻印，全国发行。外表温和的朱祐樘，做事却是个风风火火的人。
全面提速
朱祐樘执政时代，和父亲朱见深相比，最大的差别就是效率。“弘治中兴”时期，中央政府机构有明文规定，对已经熟悉的奏章，处理时间不能超过两天，对不熟悉的奏章，处理时间不能超过三天。对需要不同部门联合处理的奏章，处理时间不能超过十天。特别重大的军机事件，处理时间最多宽限五天。朱见深在位时代人浮于事的局面，一度大为扭转。
爱护动物明孝宗
明孝宗朱佑樘的俩个公认优点，就是节俭和仁慈。但这俩个好品质放在一起，有时候却也闹雷事。比如他登基后，开始叫停朱见深时代的种种享乐活动，但有个事情犯了难：朱见深还留下了一些真禽猛兽，这些动物怎么处理？喂着吧浪费粮食，杀了吧又太残忍，放出去吧，还会伤害人畜，朱祐樘答：那就不给喂食，让他们自己饿死好了。就这样饿死？
奸臣办好事
明孝宗用人，一个重要的特点，就是许多之前被看做奸臣的人物，在他的手下，反而成了能臣。典型如朱见深在位时期的佞臣刘吉，朱见深时代，他就是内阁大学士，除了善于排挤同僚外，他最主要的工作，就是逢迎拍马。当时明朝官场上送他的绰号叫“刘棉花”，意思是脸皮厚，不怕骂。
明孝宗朱祐樘登基后，开始励精图治，刘吉摇身一变，经常上书建言国家大事。而看重他能力的朱祐樘，不但没有清算他，相反留用他为内阁首辅，他担任首辅时，虽然也有打击陷害言官等恶行，但最重要的贡献，就是不费一兵一卒解决了哈密问题。
当时哈密被吐鲁番侵占，明王朝上下意见不一，刘吉提出了“闭关绝贡”的手段，即对吐鲁番进行经济封锁，逼迫其主动交还哈密。事后果然奏效。他的功劳，也恰应了一句俗话：恶人自有恶人磨。
皇上给你钱
朱祐樘得到后世称颂的，除了他的勤政与人品外，就是他对文臣的优礼。比如他极其信任的左都御史戴珊，弘治十八年(1405年)，朱祐樘接见戴珊时，特意赠给他一锭白银。并解释说：这一点钱，多少能够表彰戴珊的廉洁。皇帝给臣子送钱，明朝并非首例，但仅为表彰道德，确为首例。戴珊晚年，多次请求退休，朱祐樘对戴珊说：我把天下大事交给你，就像对待家人一样，而今太平盛世尚未实现，怎么能说走就走呢？闻言的戴珊流泪说：我只有死在任上了。
丈母娘家不好惹
“中兴之君”朱祐樘的政治污点之一，就是包庇外戚。他是中国历史上仅有的两位保持一夫一妻生活的皇帝之一。一生除了张皇后外再无嫔妃。
但物极必反，不但张皇后本人好奢华，张皇后的两个哥哥——张延龄与张鹤龄，更成了弘治朝至正德朝一霸。朱祐樘曾不顾“祖制”约束，为这哥俩在京城开商号，等于默许他们搞“官倒”。这哥俩的主要恶行，除了抢男霸女外，就是大肆圈占土地。
对他们的行为，朱祐樘有时候也采取一些啼笑皆非的处理方法：一次大理寺核查土地，秉公处理了张家兄弟强抢民田的案子，张皇后闻讯大怒，跑到朱祐樘处哭闹。结果朱祐樘耍起了“两面派”，先在张皇后面前假装生气，斥责大理寺办案不公，等着把张皇后哄高兴了，赶快偷偷派太监去大理寺传旨，内容很荒唐：这次核查土地，你们做的对，每人赏白银一百两。但是我今天夸奖你们的事，一定一定要保密啊，千万不能让皇后知道啊。
